Как заявлял замруководителя Федерального агентства морского и речного транспорта (Росморречфлот) Виктор Вовк, реализация данного проекта является единственным вариантом решения проблемы с маловодностью Дона и Цимлянского водохранилища.

Кроме того, власти Ростовской области убеждены, что с вводом гидроузла будет решен целый ряд проблем – в частности, обеспечение жителей области питьевой водой и бесперебойная работа гидросооружений Новочеркасской ГРЭС. В 2015г. электростанция несколько раз была вынуждена делать аварийные остановки.

По информации ИА «Порт-Ньюс», проект Нижне-Свирского гидроузла, который оказался исключен из ФЦП, предполагал финансирование в 13 млрд руб.

Строительства Багаевского гидроузла, которое обойдется на 9 млрд руб. дороже, потребовало пересмотреть расходы на ряд других запланированных федеральной программой мероприятий. В частности, изменения ФЦП коснулись программы строительства обслуживающего флота – вместо 159 судов, предусмотренных ранее, программа сокращается до 118 судов, общий объем финансирования подпрограммы сокращается с 18 млрд руб. до 15 млрд руб.

Кроме того, 10,7 млрд руб. до 3,87 млрд руб. сокращается финансирование проекта развития международного транспортного маршрута «Европа – Западный Китай» на территории Российской Федерации на участке Санкт-Петербург - Казань – Оренбург – граница Республики Казахстан (общей протяженностью около 2,2 тыс км).

В 2015г. из-за маловодья грузопоток за период навигации на реке Дон составил 8,7 млн тонн, что почти в два раза меньше, чем в 2014г. (14 млн тонн).
По данным ФБУ «Азово-Донская бассейновая администрация», с начала навигации 2016г. общий грузооборот в границах Азово-Донского бассейна ВВП составил 4 млн 680 тыс. тонн грузов, что на 3,3% ниже уровня аналогичного периода 2015г.